云南省职工医保余额无法直接缴纳新农合。但是，根据我国相关政策，职工医保、新农合和城镇居民医保三种不同类型的医疗保险关系可以互相转移。具体操作如下：

1. 首先，您需要办理职工医保账户的个人身份信息变更。携带身份证、社会保障卡等相关证件到当地社保局办理。

2. 办理完成后，您可以按照当地新农合参保政策，参加新型农村合作医疗保险。具体参保手续包括：携带身份证、户口本等证件到户籍所在地的村委会或乡镇社保站办理参保登记，并按规定缴纳新农合保费。

3. 参保成功后，您的职工医保账户余额将不会自动转移至新农合，而是继续保留在职工医保账户中。在参加新农合期间，您可以按照新农合的政策享受相应的医疗保险待遇。

4. 如果您从新农合转为职工医保，需要重新办理职工医保账户的身份信息变更手续。

需要注意的是，各地政策可能存在差异，具体操作流程请以当地政策为准。在办理转移过程中，如有疑问，请咨询当地医保部门。