在港澳通行证有效期限内，持证人可以随时前往中国公安机关办理签注手续。不过需要注意的是，签注到香港的时间有限制，根据香港政府规定，持港澳通行证的中国内地居民，只能每次在香港停留七天。而前往澳门则没有时间限制，可以根据个人需要灵活签注。因此建议持证人需要提前规划好行程，并在有效期内预留出办理签注的时间，以便在出行前完成签注手续。
有以下几种方法查询。
1、自助终端机查询
为方便持证人掌握签注的使用情况，内地公安机关出入境管理部门在出境大厅安装了自助查询终端机。持用电子往来港澳通行证的旅客只需将证件置于终端平台上，即可方便快捷地详细掌握自己的签注使用情况和签注剩余次数，并可为持证人打印提示条。
2、口岸自助咨询台
港澳地区主管部门将在其总部及部分口岸(主要是海港码头口岸)设置自助咨询台，为持证人本人提供查询签注信息服务。相关资料通过计算机屏幕供持证人阅读，不提供打印的提示条。
3、出入境管理部门查询
可通过在各省市的出入境管理部门，携带通行证向大厅工作人员查询。
4、微信电子查询
可以通过关注该省市出入境微信公众号查询的。例如广东居民可在微信卡包-电子港澳通行证中即可查看港澳签注剩余次数，避免用户忘记签注已经用完的情况发生。
港澳通行证的有效期内可以随时签证，但具体签证时间及审核情况视签证机构和签证类型而定。对于长期停留或工作等需要较长时间签证的情况，建议提前规划和申请，以免影响正常行程。另外，申请签证时需要提交相关材料并缴纳一定的签证费用，需要提前准备和安排。